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Sujets des écrits du concours d’agrégation externe de SVT/SV-STU 2021

Tristan FERROIR — Mon, 15 Mar 2021 21:15:03 +0000

L’agrégation externe de SVT/SV-STU 2021 se déroule en ce moment. Voici les sujets :

Secteur A (Biologie Moleculaire et Cellulaire) : « Les variations d’activité au sein de la cellule (cycle cellulaire exclus) »

Secteur B (Biologie des organismes et des populations : « Les ressemblances entre les etres vivants »

Secteur C (Sciences de la Terre et de l’univers) : « Les enveloppes externes et les enveloppes internes de la terre : Composition, formation, dynamique et évolution au cours des temps géologiques »

Un meme gene pour une protéine et un ARNlnc impliqués dans la réparation de l’ADN

Tristan FERROIR — Sat, 01 Jul 2017 08:19:42 +0000

Lorsqu’une cellule est soumis aux UV, on sait que cela a comme conséquence d’entrainer des dommages à l’ADN. Une autre conséquence aussi est de diminuer la transcription. Dans un papier datant de février, Williamson et ses collègues découvrent l’implication d’une protéine et d’un ARNlnc dans l’arret et la reprise de la transcription après réparation. Là, où l’article est particulièrement interessant c’est que la protéine et l’ARNlnc proviennent du meme gène appellé ASCC3! Les travaux des chercheurs démontrent la chose suivante :

lorsque des UV endommagent l’ADN, la première réponse est de transcrire puis traduire les enzymes de réparation mais aussi des protéines diminuant la transcription des autres gènes. Dans ce cas là, le gène ASCC3 est transcrit en un pré-ARNm qui est épissé de tel sorte qu’il donne un ARNm permettant la synthèse de la protéine ASSC3 qui diminue la transcription de différents gènes non impliqués dans la réparation. Cependant, Lorsque la réparation a été effectué, il faut bien sortir de cet état de transcription diminué
lorsque la réparation est réalisée, le gène ASCC3 est toujours transcrit mais subit un épissage alternatif qui inclue un dernier exon alternatif par rapport au premier transcrit : ceci génère cette fois-ci un ARNlnc qui contre l’action de la protéine ASCC3 et permet donc la reprise de la transcription.

Le role de la mitochondrie dans la dégradation des protéines non fonctionnelles

Tristan FERROIR — Sat, 01 Jul 2017 08:17:58 +0000

Lors d’un choc de température, on sait que la quantité de protéines mal reployées va augmenter : en effet, si la température augmente, l’agitation moléculaire augmente donc cela peut casser des liaisons faibles entre les radicaux des acides aminés, donc en mettre en place d’autres, donc indure un mauvais reploiement. On sait aussi que certaines protéines, les HSP, sont normalement chargées d’empêcher cela. Cependant, il y a tellement de protéines dans la cellule qu’une partie va forcément échapper à la surveillance. Une partie de ces protéines mal reployées vont avoir tendance à s’agréger et donc à former des complexes qui pourraient etre dangereux. Ces complexes doivent donc etre détruits. Une structure impliquée dans la destruction des protéines est le protéasome mais ce n’est pas de lui dont il est question ici. Dans un article publié dans Nature, Ruan rapporte que dans des conditions de stress thermique, les agrégats de protéines formées ont tendance à s’accumuler au niveau de la surface des mitochondries. Une protéine chaperon, HSP104, désagrège l’agrégat, et une partie est ensuite transportée à l’intérieur de la mitochondrie via le complexe TOM-TIM. Une fois dans la mitochondrie, la protéase Pim1 dégrade les protéines qui sont entrées si elle ne sont pas destinés au fonctionnement de la mitochondrie.

Les ARNe ou eRNA

Tristan FERROIR — Sat, 01 Jul 2017 08:15:33 +0000

Bose revient sur le role des séquences cis-regulatrices et ajoute un nouveau type d’ARN et une nouvelle entorse au mécanisme canonique de transcription. En effet, dans Cell, Bose et ses collègues montre l’importance d’un nouveau type d’ARN les eRNA. Ces eRNA sont des produits provenant de la transcription de séquences cis-régulatrices (eRNA veut dire ARN enhancer donc transcrits à partir de séquences enhancer) et sont donc des ARN non-codants (quand je vous disais qu’on se rend compte en réalité que tout le genome à peu près est transcrit…). Au niveau de la chromatine, certaines protéines comme CPB sont chargés d’acétyler les histones mais sont inactives schéma a). Cependant, lors de la transcription des eRNA, alors qu’ils n’ont pas été encore totalement transcrits, ils vont pouvoir intéragir avec d’autres facteurs de transcription et CPB : cette intéraction ARN-protéine va activer CPB et lui permettre d’acétyler les histones ainsi que certains facteurs de transcription (schéma b). Cette acétylation entraine le recrutement de co-activateur de la transcription qui va permettre d’activer l’activité de l’ARN Pol II qui se met alors aussi à transcrire le gène d’interet (schéma c).

Comment la tectonique des plaques a-t-elle commencé? Une histoire de tectonique des plaques et de points chauds

Tristan FERROIR — Sun, 29 Jan 2017 08:21:50 +0000

Le problème de l’initiation de la tectonique des plaques ainsi que de la mise en place de la subduction reste problématique voire énigmatique. En effet, à l’heure actuelle, l’initiation d’une subduction nécessite au préalable des forces aux limites et donc une tectoniquue des plaques ainsi que des zones de fragilité dans la lithosphère conséquence là encore de la tectonique des plaques.
Dans un papier publié dans Nature en décembre 2015, Taras GERYA propose une simulation numérique très interessante qui est en lien d’une part avec notre programme mais aussi qui permet de revenir sur une question à laquelle nous n’avons pas répondu et qui corrobore son hypothèse à savoir l’ouverture de l’océan Atlantique.

La simulation numérique ci-dessous montre la conséquence de l’arrivée d’un point chaud sur une plaque complètement homogène. Cette arrivée entraine la formation
a) de ce qu’on appelle un plateau océanique puis
b) la formation d’une fosse et d’un slab (= un panneau plongeant de lithosphère dans le manteau) de forme circulaire puis
c) un déchirement du slab puis
d) la formation d’une véritable zone de subduction avec un retrait en arrière du slab (on en reparlera dans le cours sur le magmatisme) puis
e) la formation de dorsale et de faille transformante
La colonne de gauche montre la topographie , celle de droite la morphologie de la lithosphère subduite avec la projection de la température de surface du slab
Lorsqu’on regarde la surface de la Terre à partir de cette arrivée de point chaud comme montré à droite, on constate en effet la formation de plaque lithosphérique (a) animée de mouvement vers les zones de subductions (b)

Non seulement cette simulation explique comment la tectonique des plaques a pu être initiée mais vient en appui à la théorie selon laquelle l’océan Atlantique aurait été ouvert par l’arrivée de point chaud. En effet, si on regarde la localisation des points chauds dans l’océan Atlantique, on constate qu’ils sont sur la dorsale ou très proche de la dorsale. Ces panaches mantelliques, en arrivant en surface entraine un réchauffement de la base de la lithosphère. Or, la base de la lithosphère est définie par l’isotherme 1300°C. Si la base est réchauffée, alors, elle remonte et la lithosphère devient donc plus fine à sa base. Par compensation isostasique, la partie supérieure de la lithosphère s’effondre ce qui entraine un rifting : c’est le rifting actif.

Nouvelles corrections de colles sur le nouveau programme de BCPST 2013

Tristan FERROIR — Tue, 23 Dec 2014 12:08:01 +0000

Il y en a quelques unes sur la Vache notamment.
Rendez-vous sur la page colles. J’essaierai d’en mettre encore d’autres pendant ces vacances.

Résultats d’admission du CAPES externe de SVT session exceptionnelle 2013/2014

Tristan FERROIR — Wed, 25 Jun 2014 16:20:15 +0000

Les résultats de la session 2013 bis ou 2014 A sont là Félicitations à tous! … Lire la suite →

Une classification simplifiée du vivant pour l’enseignement supérieur

Tristan FERROIR — Sat, 16 Nov 2013 11:12:38 +0000

Je me suis mis dans l’idée d’adapter la classification du vivant pour coller au programme de BCPST. Elle reprend l’ensemble des organismes du nouveau programme qui pourront être abordés au cours de la 1ère et de la 2ème année.

Elle n’est certainement pas exempte de reproche (parfois, il y a un mélange classification traditionnelle, classification phylogénétique) mais je pense qu’elle doit faire l’affaire pour ce qui est demandé en BCPST.

Si vous avez des commentaires sur la façon de l’améliorer, n’hésitez pas!

Nouvelle adresse de site

Tristan FERROIR — Sat, 07 Sep 2013 17:04:15 +0000

Notez bien que l’adresse du site a changé même si normalement vous avez été redirigé automatiquement vers le nouveau, plus rapide et plus « beau ». Si vous voyez des liens morts dus à ce changement d’adresse, merci de me le faire … Lire la suite →

TP de Secteur C – Géologie de l’agrégation externe SVT/SV-STU session 2010

Tristan FERROIR — Sun, 13 Jun 2010 13:10:09 +0000

Option C :

Contre-Option C (merci à Fanny) :

– étude d’un paysage (les pélites rouges permiennes comme à la Lieude, le trias discordant dessus et le tout surmonté d’un dyke) et des échantillons des trois roches du paysage.
– coupe dans le bassin de lodève NNW/SSE (la coupe finissait au SSE par le cirque de Mourèze en passant par un bout du lac Salagou) et interprétation
– etude de paysage: cirque de Mourèze avec un échantillon de dolomie expliquer la mise en place du paysage…
– schéma structural d’un bout de la carte de Marseille et interprétation
– datation de l’uranium de lodève: prinicipe de l’isochrone et en tracer une avec Rb/Sr pour trouver l’âge des minéralisations dans les fissures, interpréter cet age